中医理论认为，“肾”为先天之本，“肾”的功能主藏精、主生长、发育和生殖，开窍于耳及二阴。其所藏的先天之精是生殖、发育的根本。精子的生成有赖于肾阴的滋养和肾阳的温煦；肾主命门之火是促进生殖、发育的动力；其司前阴的功能直接主宰着外生殖器勃起与排精的功能。中医的“肝”、“心”、“脾”、“肺”、“肾”并不等同于西医所讲的“肝脏”（liver）、“心脏”（heart）、“脾脏”（spleen）、“肺脏”（lung）、“肾脏”（kidney），中医使用这些名称已有2千年以上的历史，由现代医学的角度来看这些名词，它们的内涵比较像是对于人体解剖生理功能分类的集合性统称。目前对于中医之“肾”所进行的研究证实，“肾”类似于“下视丘—脑垂体—性腺”轴的作用。针对“肾阳虚”所作的研究则显示了肾阳虚证不仅可引起“下视丘—脑垂体—肾上腺皮质＂轴功能紊乱，而且对于不同靶腺轴（如下视丘—脑垂体—甲状腺轴/胸腺轴/性腺轴）的不同环节，均可引起不同程度的功能紊乱和退行性病变。所以，肾气的盛衰实际上反映了内分泌的功能状态及体质的状况，也决定着生育能力的强弱。“肾虚”是男性不育的主要病理机制，研究显示补肾中药在调整“下视丘—脑垂体—性腺”轴的功能和内分泌异常，改善精子的质量，调节免疫机能等方面有所帮助。补肾法促进睾丸生精原理的研究证实，补肾药对睾丸有专一作用，有类似但又不完全等同于性激素和促性激素的作用，能促使损伤的睾丸组织（曲细精管及间质细胞等）得到改善和恢复。此外，男性不育症患者病程较长，多为久病。中医理论认为“久病必有瘀＂、“怪病必有瘀＂，“瘀血＂往往是在以往的慢性炎症、组织损伤基础上造成血运不畅，从而导致局部组织失养。因此，瘀血是男性不育的另一个主要病理机制。活血化瘀是中医的一个重要理论和治疗原则，活血化瘀类的中药可改善血液循环及神经营养，促进损伤组织的修复，改善血液理化性质，有助于改善睾丸及附睾功能。
尽管近10年来国内关于中医药治疗男性不育的研究有很多，但其中仍存在一些问题需要进一步解决：
1. 各种报导的疗效差异性颇大，约在25%~95%之间，疗效标准不统一，减少了不同治疗方案之间的可比性。
2. 有的研究纳入的病例不多，无对照组，故其疗效有待进一步确认。
3. 对于精液异常的患者，即使不经过治疗，在婚后的最初几年仍有使配偶受孕的可能，因此将配偶怀孕作为治愈标准有欠妥当。
除了药物治疗以外，患者的日常饮食生活习惯也需要注意。《济阴纲目》中记载“聚精之道，一曰寡欲，二曰节劳，三曰息怒，四曰慎味”。《妇科玉尺》亦谓“男子求嗣，所谓清心寡欲”。因此，在治疗过程中，应注意精神与生活方面的调节，缓解精神压力，稳定情绪，对男性不育症的治疗很重要。“慎味”就是饮食方面要注意，营养要均衡，不要偏食，蛋白质的补充固然不可少，新鲜蔬菜、水果等食物亦不可忽略，辛辣刺激、重口味的料理及垃圾食物应尽量避免。戒除烟酒也是一大重点。据研究显示，酗酒对于“下视丘—脑垂体—性腺”轴、睾丸、精子均有毒性作用；香烟中的尼古丁已被证明是一种助氧化剂，它会透过不同的途径来影响男性生殖能力，包括改变精子形态和存活率。此外，一些物理及化学因素，如：放射线治疗和化学治疗、热能、电磁辐射、重金属（如铅、汞、镉等）、有机氯化合物（如：多氯联苯），对男性生殖功能亦有一定的影响。
