在尖锐湿疣发生发展过程中绝大多数患者无不适感，部分患者局部会有轻度瘙痒、刺痛。
“尖锐湿疣从感染到出现临床表征一般有3到4个月的潜伏期，容易被患者忽略。”专家比较尖锐湿疣与淋病的不同，“淋病一般只有3到5天潜伏期，很快就会出现尿道流脓，身体的不适提醒病人重视并尽快治疗，病情能够得到有效控制。”
尖锐湿疣潜伏期长，症状不像其他性病那样凶、险、急，症状的隐匿性更容易造成性疾病的传播。
在尖锐湿疣发展过程中，发生部位不同可产生不同的症状，尖锐湿疣常发生于湿润的部位，如男性冠状沟、龟头、包皮内侧、尿道口，女性大小阴唇、阴道、宫颈、会阴及肛周。若损害发生在宫颈、阴道壁、阴道口、尿道口等部位时，性交摩擦后可引起疼痛、出血。局部分泌物会增多，细菌等感染机会也会增加。
由于尖锐湿疣发生发展过程中大多数患者无明显不适，因此应首先考虑自己是否有过不洁性行为，“如果有生殖器部位的赘生物无痛痒感、逐渐增大增多，形态像丘疹状、乳头状、菜花状、鸡冠状，有的表面污秽，易出血等症状，就需要到医院找医生检查。由医生对病情及严重程度进行判断。”专家说。
